في الحوزة العلمية ، وهو ما كان يُغيظ النظام كثيراً . وقد كان سيدنا المترجم له ووالده آية الله السيد محمد علي الحكيم ( مد ظله ) واخوانه وأولاده من جملة المعتقلين ( 1 ) ، وتمّ التركيز في التحقيق الذي واجهه السادة آل الحكيم في معتقل مديرية الأمن العامة سئ الصيت على مجموعة بشكل خاص منهم سماحة السيد نفسه ، إلّا ان الله تعالى بلطفه دفع عنه شرّ الظالمين ( 2 ) .